不久的未来，人类因地球拥挤不堪而迈向星河，寻找新家园的行动迫在眉睫。正当一切有条不紊地推进之时，月相异动、异物滋生，引发了长达数十年的剧烈地质变化。在这场浩劫中，人类所剩无几，地表也被玛娜生态系统侵蚀、占领，不再适宜居住。

幸存的人类登上一座飞行在空中的堡垒——“灯塔”，从此开始了流亡之旅。很久以后，“灯塔”上的人发现，被玛娜生态系统覆盖的地面上竟然有人类活动，而其中一名来历神秘的女子白月魁，似乎拥有某种特殊能力……

灾难降临前，天才脑科学家白月魁和老师霍恩研发了“天使”药剂，让大脑移植术成为可能。 就在两人准备将这一突破性技术推向全世界时，地底钻出巨型不明植物，引发地震。霍恩受伤，危在旦夕。而霍恩曾经的学生琼斯趁乱窃取了“天使”药剂……